В заповеднике “Утриш” подтверждено обитание 16 видов летучих мышей: степная ночница (Myotis davidii), длинноухая ночница (M. bechsteinii), водяная ночница (M. daubentonii), ночница Наттерера (M. nattereri), ночница Алкафеи (M. аlcathoe), малый нетопырь (Pipistrellus pygmaeus), нетопырь-карлик (P. pipistrellus), лесной нетопырь (P. nathusii), нетопырь Куля (P. kuhlii), поздний кожан (Eptesicus serotinus), двухцветный кожан (Vespertilio murinus), малая вечерница (Nyctalus leisleri), рыжая вечерница (N. noctula), бурый ушан (Plecotus auritus), европейская широкоушка (Barbastella barbastellus) и гигантская вечерница (Nyctalus lasiopterus).